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爬虫類には、かつては機能していたが、現在は退化器官となっているものが存在する。

人間の盲腸は、進化の過程で退化した器官の一例としてよく挙げられる。

進化生物学では、退化器官の研究を通じて生物の適応過程を理解しようとする。